Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.3 ms