Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sfmbt1Q9JMD1 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Sfmbt1Q9JMD1 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sfmbt1Q9JMD1 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Sfmbt1Q9JMD1 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Sfmbt1Q9JMD1 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Sfmbt1Q9JMD1 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sfmbt1Q9JMD1 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sfmbt1Q9JMD1 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sfmbt1Q9JMD1 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sfmbt1Q9JMD1 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms