Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM58

Crlf1, Cytokine receptor-like factor 1, mousemouse

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Length 425 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf1Q9JM58 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Crlf1Q9JM58 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
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