Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS5

Habp4, Intracellular hyaluronan-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Habp4Q9JKS5 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Habp4Q9JKS5 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Habp4Q9JKS5 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Habp4Q9JKS5 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Habp4Q9JKS5 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Habp4Q9JKS5 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Habp4Q9JKS5 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Habp4Q9JKS5 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Habp4Q9JKS5 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Habp4Q9JKS5 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Habp4Q9JKS5 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Habp4Q9JKS5 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Habp4Q9JKS5 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Habp4Q9JKS5 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Habp4Q9JKS5 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Habp4Q9JKS5 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Habp4Q9JKS5 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Habp4Q9JKS5 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Habp4Q9JKS5 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Habp4Q9JKS5 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Habp4Q9JKS5 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Habp4Q9JKS5 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Habp4Q9JKS5 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Habp4Q9JKS5 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Habp4Q9JKS5 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Habp4Q9JKS5 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Habp4Q9JKS5 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Habp4Q9JKS5 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Habp4Q9JKS5 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Habp4Q9JKS5 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Habp4Q9JKS5 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Habp4Q9JKS5 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Habp4Q9JKS5 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Habp4Q9JKS5 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Habp4Q9JKS5 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Habp4Q9JKS5 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Habp4Q9JKS5 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Habp4Q9JKS5 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Habp4Q9JKS5 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Habp4Q9JKS5 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Habp4Q9JKS5 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Habp4Q9JKS5 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Habp4Q9JKS5 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Habp4Q9JKS5 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Habp4Q9JKS5 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Habp4Q9JKS5 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Habp4Q9JKS5 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Habp4Q9JKS5 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Habp4Q9JKS5 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Habp4Q9JKS5 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Habp4Q9JKS5 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Habp4Q9JKS5 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Habp4Q9JKS5 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Habp4Q9JKS5 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Habp4Q9JKS5 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Habp4Q9JKS5 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Habp4Q9JKS5 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Habp4Q9JKS5 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Habp4Q9JKS5 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Habp4Q9JKS5 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Habp4Q9JKS5 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Habp4Q9JKS5 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Habp4Q9JKS5 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Habp4Q9JKS5 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Habp4Q9JKS5 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Habp4Q9JKS5 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Habp4Q9JKS5 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Habp4Q9JKS5 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Habp4Q9JKS5 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Habp4Q9JKS5 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Habp4Q9JKS5 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Habp4Q9JKS5 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Habp4Q9JKS5 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Habp4Q9JKS5 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Habp4Q9JKS5 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Habp4Q9JKS5 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Habp4Q9JKS5 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Habp4Q9JKS5 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Habp4Q9JKS5 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Habp4Q9JKS5 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Habp4Q9JKS5 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Habp4Q9JKS5 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Habp4Q9JKS5 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Habp4Q9JKS5 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Habp4Q9JKS5 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Habp4Q9JKS5 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Habp4Q9JKS5 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Habp4Q9JKS5 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Habp4Q9JKS5 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Habp4Q9JKS5 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Habp4Q9JKS5 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Habp4Q9JKS5 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Habp4Q9JKS5 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Habp4Q9JKS5 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Habp4Q9JKS5 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Habp4Q9JKS5 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Habp4Q9JKS5 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Habp4Q9JKS5 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Habp4Q9JKS5 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Habp4Q9JKS5 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms