Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL2

Ccl28, C-C motif chemokine 28, mousemouse

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Length 130 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl28Q9JIL2 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
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