Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Rb1cc1Q9ESK9 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Rb1cc1Q9ESK9 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Rb1cc1Q9ESK9 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rb1cc1Q9ESK9 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rb1cc1Q9ESK9 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rb1cc1Q9ESK9 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Rb1cc1Q9ESK9 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rb1cc1Q9ESK9 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rb1cc1Q9ESK9 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rb1cc1Q9ESK9 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rb1cc1Q9ESK9 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rb1cc1Q9ESK9 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rb1cc1Q9ESK9 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rb1cc1Q9ESK9 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rb1cc1Q9ESK9 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rb1cc1Q9ESK9 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rb1cc1Q9ESK9 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rb1cc1Q9ESK9 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rb1cc1Q9ESK9 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rb1cc1Q9ESK9 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rb1cc1Q9ESK9 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rb1cc1Q9ESK9 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Rb1cc1Q9ESK9 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rb1cc1Q9ESK9 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rb1cc1Q9ESK9 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rb1cc1Q9ESK9 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Rb1cc1Q9ESK9 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rb1cc1Q9ESK9 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rb1cc1Q9ESK9 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rb1cc1Q9ESK9 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rb1cc1Q9ESK9 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rb1cc1Q9ESK9 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rb1cc1Q9ESK9 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rb1cc1Q9ESK9 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Rb1cc1Q9ESK9 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rb1cc1Q9ESK9 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
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Rb1cc1Q9ESK9 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rb1cc1Q9ESK9 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rb1cc1Q9ESK9 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rb1cc1Q9ESK9 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rb1cc1Q9ESK9 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rb1cc1Q9ESK9 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rb1cc1Q9ESK9 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rb1cc1Q9ESK9 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rb1cc1Q9ESK9 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rb1cc1Q9ESK9 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rb1cc1Q9ESK9 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rb1cc1Q9ESK9 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
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Rb1cc1Q9ESK9 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rb1cc1Q9ESK9 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
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Rb1cc1Q9ESK9 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
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Rb1cc1Q9ESK9 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rb1cc1Q9ESK9 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
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Rb1cc1Q9ESK9 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
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Rb1cc1Q9ESK9 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rb1cc1Q9ESK9 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rb1cc1Q9ESK9 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Rb1cc1Q9ESK9 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rb1cc1Q9ESK9 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rb1cc1Q9ESK9 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rb1cc1Q9ESK9 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rb1cc1Q9ESK9 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rb1cc1Q9ESK9 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rb1cc1Q9ESK9 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rb1cc1Q9ESK9 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rb1cc1Q9ESK9 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Rb1cc1Q9ESK9 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rb1cc1Q9ESK9 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Rb1cc1Q9ESK9 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Rb1cc1Q9ESK9 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Rb1cc1Q9ESK9 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Rb1cc1Q9ESK9 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Rb1cc1Q9ESK9 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Rb1cc1Q9ESK9 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Rb1cc1Q9ESK9 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Rb1cc1Q9ESK9 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Rb1cc1Q9ESK9 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Rb1cc1Q9ESK9 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Rb1cc1Q9ESK9 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Rb1cc1Q9ESK9 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rb1cc1Q9ESK9 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rb1cc1Q9ESK9 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rb1cc1Q9ESK9 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
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