Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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