Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERR7

Selenof, Selenoprotein F, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenofQ9ERR7 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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