Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clstn1Q9EPL2 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms