Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA47

Tmem239, Transmembrane protein 239, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem239Q9DA47 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms