Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M9

Rnf138rt1, RIKEN cDNA 1700045I19, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf138rt1Q9D9M9 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf138rt1Q9D9M9 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf138rt1Q9D9M9 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf138rt1Q9D9M9 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf138rt1Q9D9M9 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf138rt1Q9D9M9 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf138rt1Q9D9M9 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf138rt1Q9D9M9 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf138rt1Q9D9M9 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf138rt1Q9D9M9 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf138rt1Q9D9M9 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf138rt1Q9D9M9 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf138rt1Q9D9M9 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf138rt1Q9D9M9 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf138rt1Q9D9M9 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf138rt1Q9D9M9 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf138rt1Q9D9M9 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf138rt1Q9D9M9 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf138rt1Q9D9M9 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf138rt1Q9D9M9 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf138rt1Q9D9M9 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf138rt1Q9D9M9 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf138rt1Q9D9M9 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf138rt1Q9D9M9 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf138rt1Q9D9M9 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf138rt1Q9D9M9 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf138rt1Q9D9M9 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf138rt1Q9D9M9 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf138rt1Q9D9M9 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf138rt1Q9D9M9 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf138rt1Q9D9M9 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf138rt1Q9D9M9 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf138rt1Q9D9M9 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf138rt1Q9D9M9 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf138rt1Q9D9M9 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf138rt1Q9D9M9 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf138rt1Q9D9M9 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf138rt1Q9D9M9 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf138rt1Q9D9M9 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf138rt1Q9D9M9 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf138rt1Q9D9M9 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf138rt1Q9D9M9 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf138rt1Q9D9M9 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf138rt1Q9D9M9 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf138rt1Q9D9M9 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf138rt1Q9D9M9 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf138rt1Q9D9M9 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf138rt1Q9D9M9 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf138rt1Q9D9M9 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf138rt1Q9D9M9 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf138rt1Q9D9M9 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf138rt1Q9D9M9 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf138rt1Q9D9M9 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf138rt1Q9D9M9 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf138rt1Q9D9M9 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf138rt1Q9D9M9 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf138rt1Q9D9M9 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf138rt1Q9D9M9 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf138rt1Q9D9M9 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf138rt1Q9D9M9 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf138rt1Q9D9M9 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf138rt1Q9D9M9 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf138rt1Q9D9M9 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf138rt1Q9D9M9 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf138rt1Q9D9M9 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf138rt1Q9D9M9 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf138rt1Q9D9M9 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf138rt1Q9D9M9 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf138rt1Q9D9M9 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf138rt1Q9D9M9 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf138rt1Q9D9M9 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf138rt1Q9D9M9 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf138rt1Q9D9M9 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf138rt1Q9D9M9 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf138rt1Q9D9M9 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf138rt1Q9D9M9 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf138rt1Q9D9M9 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf138rt1Q9D9M9 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf138rt1Q9D9M9 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf138rt1Q9D9M9 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf138rt1Q9D9M9 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf138rt1Q9D9M9 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf138rt1Q9D9M9 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf138rt1Q9D9M9 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf138rt1Q9D9M9 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf138rt1Q9D9M9 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf138rt1Q9D9M9 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf138rt1Q9D9M9 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf138rt1Q9D9M9 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms