Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms