Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F1

Alkbh4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh4Q9D8F1 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Alkbh4Q9D8F1 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Alkbh4Q9D8F1 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Alkbh4Q9D8F1 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Alkbh4Q9D8F1 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Alkbh4Q9D8F1 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Alkbh4Q9D8F1 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Alkbh4Q9D8F1 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Alkbh4Q9D8F1 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Alkbh4Q9D8F1 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Alkbh4Q9D8F1 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Alkbh4Q9D8F1 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Alkbh4Q9D8F1 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Alkbh4Q9D8F1 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Alkbh4Q9D8F1 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Alkbh4Q9D8F1 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Alkbh4Q9D8F1 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Alkbh4Q9D8F1 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Alkbh4Q9D8F1 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Alkbh4Q9D8F1 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Alkbh4Q9D8F1 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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