Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8E6

Rpl4, 60S ribosomal protein L4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl4Q9D8E6 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl4Q9D8E6 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl4Q9D8E6 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl4Q9D8E6 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl4Q9D8E6 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl4Q9D8E6 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl4Q9D8E6 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl4Q9D8E6 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl4Q9D8E6 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl4Q9D8E6 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl4Q9D8E6 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl4Q9D8E6 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl4Q9D8E6 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl4Q9D8E6 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl4Q9D8E6 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl4Q9D8E6 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl4Q9D8E6 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl4Q9D8E6 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl4Q9D8E6 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl4Q9D8E6 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl4Q9D8E6 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl4Q9D8E6 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl4Q9D8E6 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl4Q9D8E6 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl4Q9D8E6 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl4Q9D8E6 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl4Q9D8E6 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl4Q9D8E6 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl4Q9D8E6 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl4Q9D8E6 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl4Q9D8E6 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl4Q9D8E6 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl4Q9D8E6 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl4Q9D8E6 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl4Q9D8E6 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl4Q9D8E6 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl4Q9D8E6 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl4Q9D8E6 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl4Q9D8E6 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl4Q9D8E6 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl4Q9D8E6 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl4Q9D8E6 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl4Q9D8E6 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl4Q9D8E6 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpl4Q9D8E6 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpl4Q9D8E6 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpl4Q9D8E6 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpl4Q9D8E6 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpl4Q9D8E6 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpl4Q9D8E6 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpl4Q9D8E6 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpl4Q9D8E6 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpl4Q9D8E6 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpl4Q9D8E6 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpl4Q9D8E6 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpl4Q9D8E6 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpl4Q9D8E6 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpl4Q9D8E6 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpl4Q9D8E6 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpl4Q9D8E6 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpl4Q9D8E6 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpl4Q9D8E6 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpl4Q9D8E6 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpl4Q9D8E6 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpl4Q9D8E6 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpl4Q9D8E6 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Rpl4Q9D8E6 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Rpl4Q9D8E6 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpl4Q9D8E6 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpl4Q9D8E6 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpl4Q9D8E6 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpl4Q9D8E6 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpl4Q9D8E6 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpl4Q9D8E6 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpl4Q9D8E6 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpl4Q9D8E6 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpl4Q9D8E6 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpl4Q9D8E6 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpl4Q9D8E6 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpl4Q9D8E6 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpl4Q9D8E6 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpl4Q9D8E6 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpl4Q9D8E6 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpl4Q9D8E6 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpl4Q9D8E6 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpl4Q9D8E6 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpl4Q9D8E6 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpl4Q9D8E6 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpl4Q9D8E6 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpl4Q9D8E6 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpl4Q9D8E6 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpl4Q9D8E6 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpl4Q9D8E6 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpl4Q9D8E6 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpl4Q9D8E6 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpl4Q9D8E6 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpl4Q9D8E6 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpl4Q9D8E6 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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