Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B3

Chmp4b, Charged multivesicular body protein 4b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4bQ9D8B3 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chmp4bQ9D8B3 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chmp4bQ9D8B3 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chmp4bQ9D8B3 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chmp4bQ9D8B3 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chmp4bQ9D8B3 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chmp4bQ9D8B3 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chmp4bQ9D8B3 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Chmp4bQ9D8B3 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chmp4bQ9D8B3 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chmp4bQ9D8B3 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chmp4bQ9D8B3 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chmp4bQ9D8B3 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chmp4bQ9D8B3 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chmp4bQ9D8B3 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Chmp4bQ9D8B3 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chmp4bQ9D8B3 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chmp4bQ9D8B3 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chmp4bQ9D8B3 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chmp4bQ9D8B3 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chmp4bQ9D8B3 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chmp4bQ9D8B3 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chmp4bQ9D8B3 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chmp4bQ9D8B3 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chmp4bQ9D8B3 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chmp4bQ9D8B3 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chmp4bQ9D8B3 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chmp4bQ9D8B3 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chmp4bQ9D8B3 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chmp4bQ9D8B3 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chmp4bQ9D8B3 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chmp4bQ9D8B3 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chmp4bQ9D8B3 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chmp4bQ9D8B3 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chmp4bQ9D8B3 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chmp4bQ9D8B3 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chmp4bQ9D8B3 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chmp4bQ9D8B3 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chmp4bQ9D8B3 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chmp4bQ9D8B3 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chmp4bQ9D8B3 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chmp4bQ9D8B3 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chmp4bQ9D8B3 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chmp4bQ9D8B3 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chmp4bQ9D8B3 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chmp4bQ9D8B3 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chmp4bQ9D8B3 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chmp4bQ9D8B3 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chmp4bQ9D8B3 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chmp4bQ9D8B3 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chmp4bQ9D8B3 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chmp4bQ9D8B3 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chmp4bQ9D8B3 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chmp4bQ9D8B3 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chmp4bQ9D8B3 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chmp4bQ9D8B3 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chmp4bQ9D8B3 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chmp4bQ9D8B3 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chmp4bQ9D8B3 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Chmp4bQ9D8B3 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Chmp4bQ9D8B3 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Chmp4bQ9D8B3 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Chmp4bQ9D8B3 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Chmp4bQ9D8B3 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chmp4bQ9D8B3 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chmp4bQ9D8B3 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chmp4bQ9D8B3 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chmp4bQ9D8B3 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chmp4bQ9D8B3 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chmp4bQ9D8B3 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chmp4bQ9D8B3 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chmp4bQ9D8B3 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chmp4bQ9D8B3 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chmp4bQ9D8B3 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chmp4bQ9D8B3 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chmp4bQ9D8B3 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chmp4bQ9D8B3 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chmp4bQ9D8B3 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Chmp4bQ9D8B3 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chmp4bQ9D8B3 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chmp4bQ9D8B3 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chmp4bQ9D8B3 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chmp4bQ9D8B3 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chmp4bQ9D8B3 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chmp4bQ9D8B3 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chmp4bQ9D8B3 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chmp4bQ9D8B3 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chmp4bQ9D8B3 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chmp4bQ9D8B3 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Chmp4bQ9D8B3 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chmp4bQ9D8B3 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chmp4bQ9D8B3 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chmp4bQ9D8B3 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chmp4bQ9D8B3 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chmp4bQ9D8B3 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Chmp4bQ9D8B3 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chmp4bQ9D8B3 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chmp4bQ9D8B3 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chmp4bQ9D8B3 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chmp4bQ9D8B3 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms