Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S1

Tmem54, Transmembrane protein 54, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem54Q9D7S1 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem54Q9D7S1 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem54Q9D7S1 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem54Q9D7S1 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem54Q9D7S1 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem54Q9D7S1 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem54Q9D7S1 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem54Q9D7S1 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem54Q9D7S1 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem54Q9D7S1 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem54Q9D7S1 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem54Q9D7S1 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem54Q9D7S1 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem54Q9D7S1 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem54Q9D7S1 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem54Q9D7S1 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem54Q9D7S1 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem54Q9D7S1 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem54Q9D7S1 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem54Q9D7S1 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem54Q9D7S1 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Tmem54Q9D7S1 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem54Q9D7S1 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem54Q9D7S1 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem54Q9D7S1 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem54Q9D7S1 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem54Q9D7S1 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem54Q9D7S1 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem54Q9D7S1 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem54Q9D7S1 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem54Q9D7S1 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem54Q9D7S1 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem54Q9D7S1 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem54Q9D7S1 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Tmem54Q9D7S1 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem54Q9D7S1 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem54Q9D7S1 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Tmem54Q9D7S1 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem54Q9D7S1 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem54Q9D7S1 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem54Q9D7S1 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Tmem54Q9D7S1 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem54Q9D7S1 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem54Q9D7S1 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem54Q9D7S1 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem54Q9D7S1 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem54Q9D7S1 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem54Q9D7S1 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem54Q9D7S1 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem54Q9D7S1 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem54Q9D7S1 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem54Q9D7S1 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem54Q9D7S1 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem54Q9D7S1 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem54Q9D7S1 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Tmem54Q9D7S1 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem54Q9D7S1 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Tmem54Q9D7S1 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Tmem54Q9D7S1 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem54Q9D7S1 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem54Q9D7S1 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Tmem54Q9D7S1 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Tmem54Q9D7S1 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem54Q9D7S1 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Tmem54Q9D7S1 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem54Q9D7S1 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem54Q9D7S1 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem54Q9D7S1 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem54Q9D7S1 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem54Q9D7S1 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem54Q9D7S1 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem54Q9D7S1 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem54Q9D7S1 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem54Q9D7S1 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem54Q9D7S1 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem54Q9D7S1 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem54Q9D7S1 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem54Q9D7S1 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem54Q9D7S1 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem54Q9D7S1 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem54Q9D7S1 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
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Tmem54Q9D7S1 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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