Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Nop56Q9D6Z1 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nop56Q9D6Z1 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nop56Q9D6Z1 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nop56Q9D6Z1 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nop56Q9D6Z1 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Nop56Q9D6Z1 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Nop56Q9D6Z1 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Nop56Q9D6Z1 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nop56Q9D6Z1 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Nop56Q9D6Z1 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nop56Q9D6Z1 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nop56Q9D6Z1 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Nop56Q9D6Z1 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Nop56Q9D6Z1 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nop56Q9D6Z1 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nop56Q9D6Z1 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Nop56Q9D6Z1 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Nop56Q9D6Z1 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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Nop56Q9D6Z1 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Nop56Q9D6Z1 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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Nop56Q9D6Z1 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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Nop56Q9D6Z1 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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Nop56Q9D6Z1 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Nop56Q9D6Z1 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Nop56Q9D6Z1 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Nop56Q9D6Z1 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nop56Q9D6Z1 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Nop56Q9D6Z1 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Nop56Q9D6Z1 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Nop56Q9D6Z1 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Nop56Q9D6Z1 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nop56Q9D6Z1 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nop56Q9D6Z1 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nop56Q9D6Z1 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nop56Q9D6Z1 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nop56Q9D6Z1 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nop56Q9D6Z1 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nop56Q9D6Z1 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nop56Q9D6Z1 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Nop56Q9D6Z1 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nop56Q9D6Z1 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nop56Q9D6Z1 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nop56Q9D6Z1 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nop56Q9D6Z1 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nop56Q9D6Z1 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nop56Q9D6Z1 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nop56Q9D6Z1 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nop56Q9D6Z1 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nop56Q9D6Z1 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nop56Q9D6Z1 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nop56Q9D6Z1 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nop56Q9D6Z1 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Nop56Q9D6Z1 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Nop56Q9D6Z1 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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