Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6T1

Tube1, Tubulin epsilon chain, mousemouse

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Length 475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tube1Q9D6T1 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Tube1Q9D6T1 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tube1Q9D6T1 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tube1Q9D6T1 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tube1Q9D6T1 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tube1Q9D6T1 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tube1Q9D6T1 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tube1Q9D6T1 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tube1Q9D6T1 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tube1Q9D6T1 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tube1Q9D6T1 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tube1Q9D6T1 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tube1Q9D6T1 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tube1Q9D6T1 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tube1Q9D6T1 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tube1Q9D6T1 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tube1Q9D6T1 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tube1Q9D6T1 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tube1Q9D6T1 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tube1Q9D6T1 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Tube1Q9D6T1 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Tube1Q9D6T1 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tube1Q9D6T1 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tube1Q9D6T1 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tube1Q9D6T1 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tube1Q9D6T1 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tube1Q9D6T1 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tube1Q9D6T1 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tube1Q9D6T1 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tube1Q9D6T1 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tube1Q9D6T1 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tube1Q9D6T1 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Tube1Q9D6T1 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tube1Q9D6T1 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tube1Q9D6T1 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tube1Q9D6T1 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tube1Q9D6T1 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Tube1Q9D6T1 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tube1Q9D6T1 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tube1Q9D6T1 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tube1Q9D6T1 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tube1Q9D6T1 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tube1Q9D6T1 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tube1Q9D6T1 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tube1Q9D6T1 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tube1Q9D6T1 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tube1Q9D6T1 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tube1Q9D6T1 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tube1Q9D6T1 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tube1Q9D6T1 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tube1Q9D6T1 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tube1Q9D6T1 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tube1Q9D6T1 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tube1Q9D6T1 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tube1Q9D6T1 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tube1Q9D6T1 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tube1Q9D6T1 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tube1Q9D6T1 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tube1Q9D6T1 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tube1Q9D6T1 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tube1Q9D6T1 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tube1Q9D6T1 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tube1Q9D6T1 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tube1Q9D6T1 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tube1Q9D6T1 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tube1Q9D6T1 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Tube1Q9D6T1 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tube1Q9D6T1 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tube1Q9D6T1 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tube1Q9D6T1 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tube1Q9D6T1 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tube1Q9D6T1 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Tube1Q9D6T1 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tube1Q9D6T1 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tube1Q9D6T1 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tube1Q9D6T1 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tube1Q9D6T1 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tube1Q9D6T1 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tube1Q9D6T1 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tube1Q9D6T1 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tube1Q9D6T1 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tube1Q9D6T1 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tube1Q9D6T1 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Tube1Q9D6T1 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tube1Q9D6T1 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tube1Q9D6T1 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tube1Q9D6T1 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tube1Q9D6T1 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tube1Q9D6T1 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tube1Q9D6T1 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tube1Q9D6T1 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tube1Q9D6T1 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tube1Q9D6T1 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Tube1Q9D6T1 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tube1Q9D6T1 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tube1Q9D6T1 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tube1Q9D6T1 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tube1Q9D6T1 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tube1Q9D6T1 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Tube1Q9D6T1 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
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