Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc83Q9D4V3 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc83Q9D4V3 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc83Q9D4V3 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc83Q9D4V3 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc83Q9D4V3 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc83Q9D4V3 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc83Q9D4V3 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc83Q9D4V3 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc83Q9D4V3 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc83Q9D4V3 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc83Q9D4V3 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc83Q9D4V3 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc83Q9D4V3 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc83Q9D4V3 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc83Q9D4V3 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc83Q9D4V3 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc83Q9D4V3 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc83Q9D4V3 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc83Q9D4V3 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc83Q9D4V3 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc83Q9D4V3 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc83Q9D4V3 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc83Q9D4V3 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc83Q9D4V3 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc83Q9D4V3 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc83Q9D4V3 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc83Q9D4V3 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc83Q9D4V3 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc83Q9D4V3 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc83Q9D4V3 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc83Q9D4V3 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc83Q9D4V3 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc83Q9D4V3 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc83Q9D4V3 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc83Q9D4V3 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc83Q9D4V3 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc83Q9D4V3 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc83Q9D4V3 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc83Q9D4V3 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc83Q9D4V3 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc83Q9D4V3 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc83Q9D4V3 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc83Q9D4V3 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc83Q9D4V3 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc83Q9D4V3 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc83Q9D4V3 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc83Q9D4V3 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc83Q9D4V3 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc83Q9D4V3 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc83Q9D4V3 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc83Q9D4V3 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc83Q9D4V3 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc83Q9D4V3 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc83Q9D4V3 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc83Q9D4V3 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc83Q9D4V3 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc83Q9D4V3 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc83Q9D4V3 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc83Q9D4V3 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc83Q9D4V3 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc83Q9D4V3 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc83Q9D4V3 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc83Q9D4V3 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc83Q9D4V3 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc83Q9D4V3 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc83Q9D4V3 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc83Q9D4V3 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc83Q9D4V3 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc83Q9D4V3 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc83Q9D4V3 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc83Q9D4V3 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc83Q9D4V3 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc83Q9D4V3 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc83Q9D4V3 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc83Q9D4V3 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc83Q9D4V3 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc83Q9D4V3 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc83Q9D4V3 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc83Q9D4V3 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc83Q9D4V3 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc83Q9D4V3 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc83Q9D4V3 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc83Q9D4V3 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc83Q9D4V3 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc83Q9D4V3 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc83Q9D4V3 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc83Q9D4V3 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc83Q9D4V3 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc83Q9D4V3 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc83Q9D4V3 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc83Q9D4V3 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc83Q9D4V3 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc83Q9D4V3 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc83Q9D4V3 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc83Q9D4V3 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc83Q9D4V3 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc83Q9D4V3 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc83Q9D4V3 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc83Q9D4V3 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.2 ms