Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4E6

Pabpc6, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 643 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc6Q9D4E6 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Pabpc6Q9D4E6 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
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Pabpc6Q9D4E6 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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