Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms