Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2R4

Tmed11, Transmembrane emp24 domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed11Q9D2R4 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmed11Q9D2R4 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmed11Q9D2R4 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmed11Q9D2R4 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmed11Q9D2R4 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmed11Q9D2R4 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmed11Q9D2R4 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmed11Q9D2R4 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmed11Q9D2R4 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmed11Q9D2R4 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmed11Q9D2R4 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmed11Q9D2R4 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmed11Q9D2R4 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmed11Q9D2R4 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmed11Q9D2R4 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmed11Q9D2R4 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmed11Q9D2R4 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmed11Q9D2R4 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmed11Q9D2R4 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmed11Q9D2R4 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmed11Q9D2R4 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmed11Q9D2R4 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmed11Q9D2R4 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmed11Q9D2R4 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmed11Q9D2R4 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmed11Q9D2R4 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmed11Q9D2R4 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmed11Q9D2R4 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmed11Q9D2R4 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmed11Q9D2R4 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmed11Q9D2R4 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmed11Q9D2R4 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmed11Q9D2R4 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmed11Q9D2R4 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmed11Q9D2R4 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmed11Q9D2R4 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmed11Q9D2R4 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmed11Q9D2R4 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmed11Q9D2R4 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmed11Q9D2R4 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmed11Q9D2R4 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmed11Q9D2R4 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmed11Q9D2R4 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmed11Q9D2R4 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmed11Q9D2R4 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmed11Q9D2R4 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmed11Q9D2R4 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmed11Q9D2R4 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmed11Q9D2R4 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmed11Q9D2R4 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmed11Q9D2R4 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmed11Q9D2R4 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmed11Q9D2R4 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmed11Q9D2R4 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmed11Q9D2R4 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmed11Q9D2R4 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmed11Q9D2R4 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmed11Q9D2R4 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmed11Q9D2R4 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmed11Q9D2R4 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmed11Q9D2R4 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmed11Q9D2R4 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmed11Q9D2R4 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmed11Q9D2R4 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmed11Q9D2R4 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmed11Q9D2R4 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmed11Q9D2R4 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmed11Q9D2R4 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmed11Q9D2R4 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmed11Q9D2R4 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmed11Q9D2R4 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmed11Q9D2R4 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmed11Q9D2R4 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmed11Q9D2R4 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmed11Q9D2R4 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmed11Q9D2R4 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmed11Q9D2R4 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmed11Q9D2R4 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmed11Q9D2R4 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmed11Q9D2R4 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmed11Q9D2R4 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmed11Q9D2R4 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmed11Q9D2R4 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmed11Q9D2R4 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmed11Q9D2R4 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmed11Q9D2R4 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmed11Q9D2R4 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmed11Q9D2R4 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmed11Q9D2R4 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmed11Q9D2R4 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmed11Q9D2R4 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmed11Q9D2R4 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmed11Q9D2R4 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmed11Q9D2R4 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmed11Q9D2R4 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmed11Q9D2R4 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmed11Q9D2R4 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmed11Q9D2R4 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmed11Q9D2R4 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmed11Q9D2R4 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms