Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2C9

Snapc3, snRNA-activating protein complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snapc3Q9D2C9 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snapc3Q9D2C9 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snapc3Q9D2C9 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snapc3Q9D2C9 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snapc3Q9D2C9 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snapc3Q9D2C9 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snapc3Q9D2C9 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snapc3Q9D2C9 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snapc3Q9D2C9 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snapc3Q9D2C9 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snapc3Q9D2C9 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Snapc3Q9D2C9 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snapc3Q9D2C9 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snapc3Q9D2C9 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Snapc3Q9D2C9 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snapc3Q9D2C9 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snapc3Q9D2C9 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snapc3Q9D2C9 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snapc3Q9D2C9 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snapc3Q9D2C9 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snapc3Q9D2C9 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snapc3Q9D2C9 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snapc3Q9D2C9 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snapc3Q9D2C9 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snapc3Q9D2C9 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snapc3Q9D2C9 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snapc3Q9D2C9 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snapc3Q9D2C9 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snapc3Q9D2C9 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snapc3Q9D2C9 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snapc3Q9D2C9 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snapc3Q9D2C9 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snapc3Q9D2C9 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snapc3Q9D2C9 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snapc3Q9D2C9 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snapc3Q9D2C9 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snapc3Q9D2C9 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snapc3Q9D2C9 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snapc3Q9D2C9 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snapc3Q9D2C9 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snapc3Q9D2C9 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snapc3Q9D2C9 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snapc3Q9D2C9 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snapc3Q9D2C9 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snapc3Q9D2C9 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snapc3Q9D2C9 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snapc3Q9D2C9 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snapc3Q9D2C9 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snapc3Q9D2C9 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snapc3Q9D2C9 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Snapc3Q9D2C9 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snapc3Q9D2C9 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snapc3Q9D2C9 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snapc3Q9D2C9 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snapc3Q9D2C9 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snapc3Q9D2C9 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snapc3Q9D2C9 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snapc3Q9D2C9 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Snapc3Q9D2C9 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snapc3Q9D2C9 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snapc3Q9D2C9 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snapc3Q9D2C9 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snapc3Q9D2C9 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Snapc3Q9D2C9 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snapc3Q9D2C9 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Snapc3Q9D2C9 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snapc3Q9D2C9 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snapc3Q9D2C9 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snapc3Q9D2C9 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snapc3Q9D2C9 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snapc3Q9D2C9 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snapc3Q9D2C9 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snapc3Q9D2C9 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snapc3Q9D2C9 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snapc3Q9D2C9 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snapc3Q9D2C9 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snapc3Q9D2C9 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snapc3Q9D2C9 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snapc3Q9D2C9 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snapc3Q9D2C9 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snapc3Q9D2C9 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snapc3Q9D2C9 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snapc3Q9D2C9 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snapc3Q9D2C9 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snapc3Q9D2C9 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snapc3Q9D2C9 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snapc3Q9D2C9 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Snapc3Q9D2C9 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snapc3Q9D2C9 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snapc3Q9D2C9 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snapc3Q9D2C9 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snapc3Q9D2C9 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snapc3Q9D2C9 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snapc3Q9D2C9 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snapc3Q9D2C9 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snapc3Q9D2C9 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snapc3Q9D2C9 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snapc3Q9D2C9 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snapc3Q9D2C9 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snapc3Q9D2C9 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms