Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0N8

Tmem88, Transmembrane protein 88, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem88Q9D0N8 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem88Q9D0N8 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem88Q9D0N8 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem88Q9D0N8 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem88Q9D0N8 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem88Q9D0N8 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem88Q9D0N8 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem88Q9D0N8 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem88Q9D0N8 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem88Q9D0N8 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem88Q9D0N8 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem88Q9D0N8 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem88Q9D0N8 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem88Q9D0N8 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem88Q9D0N8 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem88Q9D0N8 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem88Q9D0N8 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem88Q9D0N8 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem88Q9D0N8 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem88Q9D0N8 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem88Q9D0N8 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem88Q9D0N8 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem88Q9D0N8 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem88Q9D0N8 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem88Q9D0N8 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem88Q9D0N8 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem88Q9D0N8 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem88Q9D0N8 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem88Q9D0N8 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem88Q9D0N8 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem88Q9D0N8 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem88Q9D0N8 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Tmem88Q9D0N8 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem88Q9D0N8 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem88Q9D0N8 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Tmem88Q9D0N8 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem88Q9D0N8 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem88Q9D0N8 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem88Q9D0N8 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem88Q9D0N8 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem88Q9D0N8 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem88Q9D0N8 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem88Q9D0N8 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem88Q9D0N8 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem88Q9D0N8 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem88Q9D0N8 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem88Q9D0N8 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem88Q9D0N8 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
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Tmem88Q9D0N8 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem88Q9D0N8 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem88Q9D0N8 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem88Q9D0N8 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem88Q9D0N8 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem88Q9D0N8 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem88Q9D0N8 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem88Q9D0N8 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem88Q9D0N8 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Tmem88Q9D0N8 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Tmem88Q9D0N8 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem88Q9D0N8 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem88Q9D0N8 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem88Q9D0N8 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem88Q9D0N8 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem88Q9D0N8 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem88Q9D0N8 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem88Q9D0N8 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem88Q9D0N8 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem88Q9D0N8 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem88Q9D0N8 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem88Q9D0N8 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem88Q9D0N8 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem88Q9D0N8 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem88Q9D0N8 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem88Q9D0N8 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem88Q9D0N8 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem88Q9D0N8 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem88Q9D0N8 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem88Q9D0N8 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem88Q9D0N8 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem88Q9D0N8 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem88Q9D0N8 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem88Q9D0N8 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem88Q9D0N8 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem88Q9D0N8 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem88Q9D0N8 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem88Q9D0N8 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem88Q9D0N8 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem88Q9D0N8 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem88Q9D0N8 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem88Q9D0N8 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem88Q9D0N8 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem88Q9D0N8 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem88Q9D0N8 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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