Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN7

Shmt2, Serine hydroxymethyltransferase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shmt2Q9CZN7 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Shmt2Q9CZN7 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Shmt2Q9CZN7 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Shmt2Q9CZN7 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Shmt2Q9CZN7 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Shmt2Q9CZN7 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Shmt2Q9CZN7 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Shmt2Q9CZN7 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Shmt2Q9CZN7 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Shmt2Q9CZN7 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Shmt2Q9CZN7 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Shmt2Q9CZN7 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Shmt2Q9CZN7 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Shmt2Q9CZN7 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Shmt2Q9CZN7 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Shmt2Q9CZN7 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Shmt2Q9CZN7 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Shmt2Q9CZN7 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Shmt2Q9CZN7 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Shmt2Q9CZN7 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Shmt2Q9CZN7 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Shmt2Q9CZN7 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Shmt2Q9CZN7 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Shmt2Q9CZN7 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Shmt2Q9CZN7 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Shmt2Q9CZN7 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Shmt2Q9CZN7 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Shmt2Q9CZN7 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Shmt2Q9CZN7 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Shmt2Q9CZN7 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Shmt2Q9CZN7 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Shmt2Q9CZN7 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Shmt2Q9CZN7 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Shmt2Q9CZN7 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Shmt2Q9CZN7 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Shmt2Q9CZN7 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Shmt2Q9CZN7 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Shmt2Q9CZN7 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Shmt2Q9CZN7 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Shmt2Q9CZN7 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Shmt2Q9CZN7 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Shmt2Q9CZN7 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Shmt2Q9CZN7 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Shmt2Q9CZN7 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Shmt2Q9CZN7 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Shmt2Q9CZN7 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Shmt2Q9CZN7 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Shmt2Q9CZN7 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Shmt2Q9CZN7 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Shmt2Q9CZN7 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Shmt2Q9CZN7 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Shmt2Q9CZN7 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Shmt2Q9CZN7 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Shmt2Q9CZN7 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Shmt2Q9CZN7 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Shmt2Q9CZN7 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Shmt2Q9CZN7 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Shmt2Q9CZN7 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Shmt2Q9CZN7 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Shmt2Q9CZN7 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Shmt2Q9CZN7 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Shmt2Q9CZN7 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Shmt2Q9CZN7 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Shmt2Q9CZN7 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Shmt2Q9CZN7 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Shmt2Q9CZN7 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Shmt2Q9CZN7 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Shmt2Q9CZN7 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Shmt2Q9CZN7 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Shmt2Q9CZN7 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Shmt2Q9CZN7 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Shmt2Q9CZN7 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Shmt2Q9CZN7 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Shmt2Q9CZN7 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Shmt2Q9CZN7 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Shmt2Q9CZN7 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Shmt2Q9CZN7 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Shmt2Q9CZN7 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Shmt2Q9CZN7 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Shmt2Q9CZN7 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Shmt2Q9CZN7 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Shmt2Q9CZN7 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Shmt2Q9CZN7 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Shmt2Q9CZN7 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Shmt2Q9CZN7 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Shmt2Q9CZN7 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Shmt2Q9CZN7 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Shmt2Q9CZN7 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Shmt2Q9CZN7 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Shmt2Q9CZN7 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Shmt2Q9CZN7 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Shmt2Q9CZN7 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Shmt2Q9CZN7 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Shmt2Q9CZN7 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Shmt2Q9CZN7 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Shmt2Q9CZN7 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Shmt2Q9CZN7 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Shmt2Q9CZN7 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Shmt2Q9CZN7 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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