Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYW4

Hdhd3, Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdhd3Q9CYW4 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hdhd3Q9CYW4 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hdhd3Q9CYW4 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hdhd3Q9CYW4 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hdhd3Q9CYW4 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hdhd3Q9CYW4 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hdhd3Q9CYW4 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hdhd3Q9CYW4 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hdhd3Q9CYW4 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hdhd3Q9CYW4 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hdhd3Q9CYW4 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hdhd3Q9CYW4 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hdhd3Q9CYW4 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hdhd3Q9CYW4 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hdhd3Q9CYW4 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hdhd3Q9CYW4 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hdhd3Q9CYW4 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hdhd3Q9CYW4 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Hdhd3Q9CYW4 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hdhd3Q9CYW4 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hdhd3Q9CYW4 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hdhd3Q9CYW4 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hdhd3Q9CYW4 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hdhd3Q9CYW4 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hdhd3Q9CYW4 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hdhd3Q9CYW4 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Hdhd3Q9CYW4 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hdhd3Q9CYW4 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hdhd3Q9CYW4 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hdhd3Q9CYW4 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hdhd3Q9CYW4 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hdhd3Q9CYW4 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hdhd3Q9CYW4 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Hdhd3Q9CYW4 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hdhd3Q9CYW4 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hdhd3Q9CYW4 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hdhd3Q9CYW4 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hdhd3Q9CYW4 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hdhd3Q9CYW4 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hdhd3Q9CYW4 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hdhd3Q9CYW4 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hdhd3Q9CYW4 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hdhd3Q9CYW4 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hdhd3Q9CYW4 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hdhd3Q9CYW4 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hdhd3Q9CYW4 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hdhd3Q9CYW4 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hdhd3Q9CYW4 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hdhd3Q9CYW4 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hdhd3Q9CYW4 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hdhd3Q9CYW4 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hdhd3Q9CYW4 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hdhd3Q9CYW4 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hdhd3Q9CYW4 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hdhd3Q9CYW4 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hdhd3Q9CYW4 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hdhd3Q9CYW4 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hdhd3Q9CYW4 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hdhd3Q9CYW4 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hdhd3Q9CYW4 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hdhd3Q9CYW4 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hdhd3Q9CYW4 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hdhd3Q9CYW4 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hdhd3Q9CYW4 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hdhd3Q9CYW4 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hdhd3Q9CYW4 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hdhd3Q9CYW4 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hdhd3Q9CYW4 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hdhd3Q9CYW4 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hdhd3Q9CYW4 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Hdhd3Q9CYW4 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Hdhd3Q9CYW4 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Hdhd3Q9CYW4 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Hdhd3Q9CYW4 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Hdhd3Q9CYW4 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Hdhd3Q9CYW4 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Hdhd3Q9CYW4 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Hdhd3Q9CYW4 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Hdhd3Q9CYW4 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Hdhd3Q9CYW4 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hdhd3Q9CYW4 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hdhd3Q9CYW4 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hdhd3Q9CYW4 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hdhd3Q9CYW4 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hdhd3Q9CYW4 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hdhd3Q9CYW4 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hdhd3Q9CYW4 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hdhd3Q9CYW4 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hdhd3Q9CYW4 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hdhd3Q9CYW4 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hdhd3Q9CYW4 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hdhd3Q9CYW4 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hdhd3Q9CYW4 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hdhd3Q9CYW4 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Hdhd3Q9CYW4 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hdhd3Q9CYW4 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hdhd3Q9CYW4 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hdhd3Q9CYW4 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hdhd3Q9CYW4 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hdhd3Q9CYW4 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms