Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXV1

Sdhd, Succinate dehydrogenase [ubiquinone] cytochrome b small subunit, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SdhdQ9CXV1 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SdhdQ9CXV1 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SdhdQ9CXV1 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SdhdQ9CXV1 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SdhdQ9CXV1 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SdhdQ9CXV1 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
SdhdQ9CXV1 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
SdhdQ9CXV1 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SdhdQ9CXV1 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SdhdQ9CXV1 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SdhdQ9CXV1 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SdhdQ9CXV1 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SdhdQ9CXV1 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SdhdQ9CXV1 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SdhdQ9CXV1 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SdhdQ9CXV1 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SdhdQ9CXV1 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
SdhdQ9CXV1 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SdhdQ9CXV1 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SdhdQ9CXV1 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SdhdQ9CXV1 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SdhdQ9CXV1 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SdhdQ9CXV1 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SdhdQ9CXV1 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SdhdQ9CXV1 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SdhdQ9CXV1 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SdhdQ9CXV1 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SdhdQ9CXV1 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SdhdQ9CXV1 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SdhdQ9CXV1 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SdhdQ9CXV1 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SdhdQ9CXV1 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SdhdQ9CXV1 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SdhdQ9CXV1 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SdhdQ9CXV1 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SdhdQ9CXV1 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SdhdQ9CXV1 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SdhdQ9CXV1 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SdhdQ9CXV1 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SdhdQ9CXV1 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SdhdQ9CXV1 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SdhdQ9CXV1 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SdhdQ9CXV1 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SdhdQ9CXV1 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SdhdQ9CXV1 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SdhdQ9CXV1 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SdhdQ9CXV1 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SdhdQ9CXV1 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SdhdQ9CXV1 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SdhdQ9CXV1 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SdhdQ9CXV1 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SdhdQ9CXV1 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SdhdQ9CXV1 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SdhdQ9CXV1 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SdhdQ9CXV1 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SdhdQ9CXV1 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SdhdQ9CXV1 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SdhdQ9CXV1 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SdhdQ9CXV1 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SdhdQ9CXV1 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SdhdQ9CXV1 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SdhdQ9CXV1 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SdhdQ9CXV1 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SdhdQ9CXV1 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SdhdQ9CXV1 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SdhdQ9CXV1 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SdhdQ9CXV1 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SdhdQ9CXV1 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SdhdQ9CXV1 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SdhdQ9CXV1 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SdhdQ9CXV1 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SdhdQ9CXV1 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SdhdQ9CXV1 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SdhdQ9CXV1 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SdhdQ9CXV1 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SdhdQ9CXV1 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SdhdQ9CXV1 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SdhdQ9CXV1 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SdhdQ9CXV1 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SdhdQ9CXV1 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SdhdQ9CXV1 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SdhdQ9CXV1 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SdhdQ9CXV1 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SdhdQ9CXV1 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SdhdQ9CXV1 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SdhdQ9CXV1 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SdhdQ9CXV1 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SdhdQ9CXV1 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SdhdQ9CXV1 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SdhdQ9CXV1 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SdhdQ9CXV1 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SdhdQ9CXV1 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SdhdQ9CXV1 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SdhdQ9CXV1 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SdhdQ9CXV1 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SdhdQ9CXV1 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SdhdQ9CXV1 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SdhdQ9CXV1 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SdhdQ9CXV1 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SdhdQ9CXV1 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms