Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXT8

Pmpcb, Mitochondrial-processing peptidase subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PmpcbQ9CXT8 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PmpcbQ9CXT8 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PmpcbQ9CXT8 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PmpcbQ9CXT8 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PmpcbQ9CXT8 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PmpcbQ9CXT8 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PmpcbQ9CXT8 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PmpcbQ9CXT8 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PmpcbQ9CXT8 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PmpcbQ9CXT8 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PmpcbQ9CXT8 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PmpcbQ9CXT8 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PmpcbQ9CXT8 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PmpcbQ9CXT8 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PmpcbQ9CXT8 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PmpcbQ9CXT8 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PmpcbQ9CXT8 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PmpcbQ9CXT8 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PmpcbQ9CXT8 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PmpcbQ9CXT8 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PmpcbQ9CXT8 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PmpcbQ9CXT8 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PmpcbQ9CXT8 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PmpcbQ9CXT8 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PmpcbQ9CXT8 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PmpcbQ9CXT8 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PmpcbQ9CXT8 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PmpcbQ9CXT8 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PmpcbQ9CXT8 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PmpcbQ9CXT8 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PmpcbQ9CXT8 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PmpcbQ9CXT8 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PmpcbQ9CXT8 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PmpcbQ9CXT8 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PmpcbQ9CXT8 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PmpcbQ9CXT8 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PmpcbQ9CXT8 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PmpcbQ9CXT8 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PmpcbQ9CXT8 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PmpcbQ9CXT8 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PmpcbQ9CXT8 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PmpcbQ9CXT8 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PmpcbQ9CXT8 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PmpcbQ9CXT8 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PmpcbQ9CXT8 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PmpcbQ9CXT8 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PmpcbQ9CXT8 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PmpcbQ9CXT8 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PmpcbQ9CXT8 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PmpcbQ9CXT8 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PmpcbQ9CXT8 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PmpcbQ9CXT8 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PmpcbQ9CXT8 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PmpcbQ9CXT8 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PmpcbQ9CXT8 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PmpcbQ9CXT8 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PmpcbQ9CXT8 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PmpcbQ9CXT8 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PmpcbQ9CXT8 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PmpcbQ9CXT8 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PmpcbQ9CXT8 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PmpcbQ9CXT8 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PmpcbQ9CXT8 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PmpcbQ9CXT8 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PmpcbQ9CXT8 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PmpcbQ9CXT8 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PmpcbQ9CXT8 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PmpcbQ9CXT8 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PmpcbQ9CXT8 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PmpcbQ9CXT8 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PmpcbQ9CXT8 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PmpcbQ9CXT8 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PmpcbQ9CXT8 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PmpcbQ9CXT8 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PmpcbQ9CXT8 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PmpcbQ9CXT8 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PmpcbQ9CXT8 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PmpcbQ9CXT8 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PmpcbQ9CXT8 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PmpcbQ9CXT8 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PmpcbQ9CXT8 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PmpcbQ9CXT8 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PmpcbQ9CXT8 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PmpcbQ9CXT8 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PmpcbQ9CXT8 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PmpcbQ9CXT8 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PmpcbQ9CXT8 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PmpcbQ9CXT8 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PmpcbQ9CXT8 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PmpcbQ9CXT8 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PmpcbQ9CXT8 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PmpcbQ9CXT8 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PmpcbQ9CXT8 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PmpcbQ9CXT8 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PmpcbQ9CXT8 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PmpcbQ9CXT8 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PmpcbQ9CXT8 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PmpcbQ9CXT8 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PmpcbQ9CXT8 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PmpcbQ9CXT8 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms