Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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