Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prkrip1Q9CWV6 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Prkrip1Q9CWV6 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prkrip1Q9CWV6 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prkrip1Q9CWV6 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prkrip1Q9CWV6 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prkrip1Q9CWV6 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prkrip1Q9CWV6 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prkrip1Q9CWV6 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prkrip1Q9CWV6 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prkrip1Q9CWV6 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prkrip1Q9CWV6 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prkrip1Q9CWV6 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prkrip1Q9CWV6 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prkrip1Q9CWV6 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prkrip1Q9CWV6 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prkrip1Q9CWV6 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prkrip1Q9CWV6 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prkrip1Q9CWV6 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prkrip1Q9CWV6 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prkrip1Q9CWV6 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prkrip1Q9CWV6 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prkrip1Q9CWV6 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prkrip1Q9CWV6 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prkrip1Q9CWV6 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prkrip1Q9CWV6 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prkrip1Q9CWV6 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prkrip1Q9CWV6 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prkrip1Q9CWV6 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prkrip1Q9CWV6 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prkrip1Q9CWV6 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prkrip1Q9CWV6 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prkrip1Q9CWV6 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms