Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWN7

Cnot11, CCR4-NOT transcription complex subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot11Q9CWN7 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnot11Q9CWN7 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnot11Q9CWN7 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnot11Q9CWN7 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnot11Q9CWN7 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnot11Q9CWN7 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnot11Q9CWN7 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnot11Q9CWN7 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnot11Q9CWN7 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnot11Q9CWN7 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnot11Q9CWN7 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnot11Q9CWN7 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnot11Q9CWN7 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnot11Q9CWN7 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnot11Q9CWN7 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnot11Q9CWN7 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnot11Q9CWN7 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnot11Q9CWN7 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnot11Q9CWN7 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnot11Q9CWN7 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnot11Q9CWN7 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnot11Q9CWN7 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnot11Q9CWN7 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnot11Q9CWN7 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnot11Q9CWN7 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnot11Q9CWN7 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnot11Q9CWN7 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnot11Q9CWN7 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cnot11Q9CWN7 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cnot11Q9CWN7 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cnot11Q9CWN7 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cnot11Q9CWN7 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cnot11Q9CWN7 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cnot11Q9CWN7 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cnot11Q9CWN7 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cnot11Q9CWN7 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Cnot11Q9CWN7 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cnot11Q9CWN7 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cnot11Q9CWN7 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cnot11Q9CWN7 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cnot11Q9CWN7 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Cnot11Q9CWN7 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cnot11Q9CWN7 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cnot11Q9CWN7 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Cnot11Q9CWN7 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cnot11Q9CWN7 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cnot11Q9CWN7 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cnot11Q9CWN7 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cnot11Q9CWN7 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Cnot11Q9CWN7 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cnot11Q9CWN7 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cnot11Q9CWN7 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cnot11Q9CWN7 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cnot11Q9CWN7 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cnot11Q9CWN7 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cnot11Q9CWN7 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cnot11Q9CWN7 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cnot11Q9CWN7 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cnot11Q9CWN7 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cnot11Q9CWN7 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cnot11Q9CWN7 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cnot11Q9CWN7 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cnot11Q9CWN7 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cnot11Q9CWN7 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cnot11Q9CWN7 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cnot11Q9CWN7 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cnot11Q9CWN7 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cnot11Q9CWN7 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cnot11Q9CWN7 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cnot11Q9CWN7 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cnot11Q9CWN7 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cnot11Q9CWN7 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cnot11Q9CWN7 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cnot11Q9CWN7 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cnot11Q9CWN7 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cnot11Q9CWN7 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cnot11Q9CWN7 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cnot11Q9CWN7 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Cnot11Q9CWN7 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cnot11Q9CWN7 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cnot11Q9CWN7 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cnot11Q9CWN7 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cnot11Q9CWN7 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Cnot11Q9CWN7 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cnot11Q9CWN7 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cnot11Q9CWN7 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Cnot11Q9CWN7 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cnot11Q9CWN7 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cnot11Q9CWN7 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Cnot11Q9CWN7 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cnot11Q9CWN7 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cnot11Q9CWN7 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cnot11Q9CWN7 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cnot11Q9CWN7 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cnot11Q9CWN7 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cnot11Q9CWN7 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cnot11Q9CWN7 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cnot11Q9CWN7 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cnot11Q9CWN7 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cnot11Q9CWN7 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms