Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM2

Cdca4, Cell division cycle-associated protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca4Q9CWM2 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cdca4Q9CWM2 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cdca4Q9CWM2 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cdca4Q9CWM2 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cdca4Q9CWM2 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cdca4Q9CWM2 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cdca4Q9CWM2 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cdca4Q9CWM2 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cdca4Q9CWM2 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cdca4Q9CWM2 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cdca4Q9CWM2 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cdca4Q9CWM2 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cdca4Q9CWM2 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cdca4Q9CWM2 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cdca4Q9CWM2 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cdca4Q9CWM2 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cdca4Q9CWM2 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cdca4Q9CWM2 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cdca4Q9CWM2 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cdca4Q9CWM2 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cdca4Q9CWM2 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cdca4Q9CWM2 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cdca4Q9CWM2 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cdca4Q9CWM2 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cdca4Q9CWM2 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cdca4Q9CWM2 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cdca4Q9CWM2 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cdca4Q9CWM2 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cdca4Q9CWM2 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cdca4Q9CWM2 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cdca4Q9CWM2 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cdca4Q9CWM2 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cdca4Q9CWM2 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cdca4Q9CWM2 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Cdca4Q9CWM2 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cdca4Q9CWM2 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cdca4Q9CWM2 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cdca4Q9CWM2 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cdca4Q9CWM2 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cdca4Q9CWM2 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cdca4Q9CWM2 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cdca4Q9CWM2 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cdca4Q9CWM2 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cdca4Q9CWM2 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cdca4Q9CWM2 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cdca4Q9CWM2 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cdca4Q9CWM2 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Cdca4Q9CWM2 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cdca4Q9CWM2 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cdca4Q9CWM2 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cdca4Q9CWM2 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cdca4Q9CWM2 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Cdca4Q9CWM2 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cdca4Q9CWM2 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cdca4Q9CWM2 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cdca4Q9CWM2 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cdca4Q9CWM2 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Cdca4Q9CWM2 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cdca4Q9CWM2 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cdca4Q9CWM2 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cdca4Q9CWM2 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cdca4Q9CWM2 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cdca4Q9CWM2 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Cdca4Q9CWM2 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cdca4Q9CWM2 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cdca4Q9CWM2 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Cdca4Q9CWM2 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cdca4Q9CWM2 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cdca4Q9CWM2 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cdca4Q9CWM2 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cdca4Q9CWM2 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cdca4Q9CWM2 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cdca4Q9CWM2 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cdca4Q9CWM2 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cdca4Q9CWM2 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cdca4Q9CWM2 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cdca4Q9CWM2 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cdca4Q9CWM2 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cdca4Q9CWM2 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cdca4Q9CWM2 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Cdca4Q9CWM2 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cdca4Q9CWM2 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cdca4Q9CWM2 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cdca4Q9CWM2 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cdca4Q9CWM2 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cdca4Q9CWM2 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cdca4Q9CWM2 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cdca4Q9CWM2 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cdca4Q9CWM2 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cdca4Q9CWM2 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cdca4Q9CWM2 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cdca4Q9CWM2 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Cdca4Q9CWM2 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Cdca4Q9CWM2 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cdca4Q9CWM2 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cdca4Q9CWM2 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cdca4Q9CWM2 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cdca4Q9CWM2 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cdca4Q9CWM2 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cdca4Q9CWM2 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms