Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms