Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT5

Pomp, Proteasome maturation protein, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PompQ9CQT5 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PompQ9CQT5 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PompQ9CQT5 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PompQ9CQT5 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PompQ9CQT5 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PompQ9CQT5 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PompQ9CQT5 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PompQ9CQT5 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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PompQ9CQT5 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PompQ9CQT5 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
PompQ9CQT5 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PompQ9CQT5 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PompQ9CQT5 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PompQ9CQT5 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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PompQ9CQT5 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PompQ9CQT5 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PompQ9CQT5 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PompQ9CQT5 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PompQ9CQT5 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PompQ9CQT5 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PompQ9CQT5 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PompQ9CQT5 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PompQ9CQT5 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PompQ9CQT5 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PompQ9CQT5 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PompQ9CQT5 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PompQ9CQT5 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PompQ9CQT5 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PompQ9CQT5 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PompQ9CQT5 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PompQ9CQT5 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PompQ9CQT5 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PompQ9CQT5 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PompQ9CQT5 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PompQ9CQT5 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PompQ9CQT5 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PompQ9CQT5 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PompQ9CQT5 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PompQ9CQT5 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PompQ9CQT5 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
PompQ9CQT5 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PompQ9CQT5 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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PompQ9CQT5 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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PompQ9CQT5 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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PompQ9CQT5 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
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PompQ9CQT5 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PompQ9CQT5 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PompQ9CQT5 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
PompQ9CQT5 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
PompQ9CQT5 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PompQ9CQT5 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PompQ9CQT5 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
PompQ9CQT5 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
PompQ9CQT5 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PompQ9CQT5 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PompQ9CQT5 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
PompQ9CQT5 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PompQ9CQT5 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PompQ9CQT5 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
PompQ9CQT5 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
PompQ9CQT5 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
PompQ9CQT5 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PompQ9CQT5 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.34
PompQ9CQT5 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
PompQ9CQT5 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PompQ9CQT5 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PompQ9CQT5 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PompQ9CQT5 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PompQ9CQT5 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms