Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQP3

Chchd5, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd5Q9CQP3 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms