Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nudt21Q9CQF3 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nudt21Q9CQF3 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nudt21Q9CQF3 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nudt21Q9CQF3 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nudt21Q9CQF3 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nudt21Q9CQF3 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nudt21Q9CQF3 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Nudt21Q9CQF3 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nudt21Q9CQF3 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Nudt21Q9CQF3 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nudt21Q9CQF3 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Nudt21Q9CQF3 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Nudt21Q9CQF3 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Nudt21Q9CQF3 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Nudt21Q9CQF3 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Nudt21Q9CQF3 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Nudt21Q9CQF3 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nudt21Q9CQF3 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nudt21Q9CQF3 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nudt21Q9CQF3 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nudt21Q9CQF3 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nudt21Q9CQF3 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nudt21Q9CQF3 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nudt21Q9CQF3 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nudt21Q9CQF3 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nudt21Q9CQF3 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nudt21Q9CQF3 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nudt21Q9CQF3 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Nudt21Q9CQF3 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nudt21Q9CQF3 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nudt21Q9CQF3 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nudt21Q9CQF3 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nudt21Q9CQF3 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nudt21Q9CQF3 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nudt21Q9CQF3 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nudt21Q9CQF3 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nudt21Q9CQF3 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nudt21Q9CQF3 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nudt21Q9CQF3 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nudt21Q9CQF3 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nudt21Q9CQF3 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nudt21Q9CQF3 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Nudt21Q9CQF3 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Nudt21Q9CQF3 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Nudt21Q9CQF3 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Nudt21Q9CQF3 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Nudt21Q9CQF3 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Nudt21Q9CQF3 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Nudt21Q9CQF3 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Nudt21Q9CQF3 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Nudt21Q9CQF3 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Nudt21Q9CQF3 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Nudt21Q9CQF3 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Nudt21Q9CQF3 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Nudt21Q9CQF3 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Nudt21Q9CQF3 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Nudt21Q9CQF3 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Nudt21Q9CQF3 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Nudt21Q9CQF3 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Nudt21Q9CQF3 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Nudt21Q9CQF3 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Nudt21Q9CQF3 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Nudt21Q9CQF3 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Nudt21Q9CQF3 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Nudt21Q9CQF3 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Nudt21Q9CQF3 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Nudt21Q9CQF3 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Nudt21Q9CQF3 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Nudt21Q9CQF3 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Nudt21Q9CQF3 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Nudt21Q9CQF3 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Nudt21Q9CQF3 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Nudt21Q9CQF3 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Nudt21Q9CQF3 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Nudt21Q9CQF3 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Nudt21Q9CQF3 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Nudt21Q9CQF3 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Nudt21Q9CQF3 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Nudt21Q9CQF3 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Nudt21Q9CQF3 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Nudt21Q9CQF3 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Nudt21Q9CQF3 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Nudt21Q9CQF3 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Nudt21Q9CQF3 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Nudt21Q9CQF3 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Nudt21Q9CQF3 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Nudt21Q9CQF3 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Nudt21Q9CQF3 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Nudt21Q9CQF3 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Nudt21Q9CQF3 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Nudt21Q9CQF3 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Nudt21Q9CQF3 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Nudt21Q9CQF3 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Nudt21Q9CQF3 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Nudt21Q9CQF3 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Nudt21Q9CQF3 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Nudt21Q9CQF3 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Nudt21Q9CQF3 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Nudt21Q9CQF3 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
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