Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA1

Trappc5, Trafficking protein particle complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc5Q9CQA1 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc5Q9CQA1 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc5Q9CQA1 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc5Q9CQA1 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc5Q9CQA1 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc5Q9CQA1 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc5Q9CQA1 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc5Q9CQA1 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc5Q9CQA1 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc5Q9CQA1 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc5Q9CQA1 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc5Q9CQA1 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc5Q9CQA1 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc5Q9CQA1 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc5Q9CQA1 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Trappc5Q9CQA1 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc5Q9CQA1 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc5Q9CQA1 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc5Q9CQA1 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Trappc5Q9CQA1 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc5Q9CQA1 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc5Q9CQA1 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc5Q9CQA1 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc5Q9CQA1 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc5Q9CQA1 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc5Q9CQA1 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc5Q9CQA1 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc5Q9CQA1 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc5Q9CQA1 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc5Q9CQA1 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc5Q9CQA1 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc5Q9CQA1 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc5Q9CQA1 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc5Q9CQA1 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc5Q9CQA1 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc5Q9CQA1 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc5Q9CQA1 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc5Q9CQA1 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Trappc5Q9CQA1 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Trappc5Q9CQA1 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc5Q9CQA1 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc5Q9CQA1 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc5Q9CQA1 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Trappc5Q9CQA1 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Trappc5Q9CQA1 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Trappc5Q9CQA1 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc5Q9CQA1 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc5Q9CQA1 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc5Q9CQA1 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Trappc5Q9CQA1 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc5Q9CQA1 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc5Q9CQA1 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc5Q9CQA1 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc5Q9CQA1 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc5Q9CQA1 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trappc5Q9CQA1 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trappc5Q9CQA1 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trappc5Q9CQA1 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trappc5Q9CQA1 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trappc5Q9CQA1 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trappc5Q9CQA1 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Trappc5Q9CQA1 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trappc5Q9CQA1 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Trappc5Q9CQA1 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms