Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV5

Bhlhe41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe41Q99PV5 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Bhlhe41Q99PV5 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms