Protein–RNA interactions for Protein: Q99P81

Abcg3, ATP-binding cassette sub-family G member 3, mousemouse

Predictions only

Length 650 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcg3Q99P81 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Abcg3Q99P81 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Abcg3Q99P81 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Abcg3Q99P81 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Abcg3Q99P81 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Abcg3Q99P81 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Abcg3Q99P81 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Abcg3Q99P81 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Abcg3Q99P81 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Abcg3Q99P81 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Abcg3Q99P81 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Abcg3Q99P81 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Abcg3Q99P81 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Abcg3Q99P81 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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Abcg3Q99P81 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Abcg3Q99P81 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Abcg3Q99P81 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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Abcg3Q99P81 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Abcg3Q99P81 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Abcg3Q99P81 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Abcg3Q99P81 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Abcg3Q99P81 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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Abcg3Q99P81 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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Abcg3Q99P81 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Abcg3Q99P81 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Abcg3Q99P81 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Abcg3Q99P81 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Abcg3Q99P81 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Abcg3Q99P81 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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Abcg3Q99P81 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Abcg3Q99P81 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Abcg3Q99P81 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Abcg3Q99P81 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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Abcg3Q99P81 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Abcg3Q99P81 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Abcg3Q99P81 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Abcg3Q99P81 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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Abcg3Q99P81 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Abcg3Q99P81 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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Abcg3Q99P81 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Abcg3Q99P81 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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Abcg3Q99P81 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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Abcg3Q99P81 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Abcg3Q99P81 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Abcg3Q99P81 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Abcg3Q99P81 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Abcg3Q99P81 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Abcg3Q99P81 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Abcg3Q99P81 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Abcg3Q99P81 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Abcg3Q99P81 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Abcg3Q99P81 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Abcg3Q99P81 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Abcg3Q99P81 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Abcg3Q99P81 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Abcg3Q99P81 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Abcg3Q99P81 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Abcg3Q99P81 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Abcg3Q99P81 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Abcg3Q99P81 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Abcg3Q99P81 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Abcg3Q99P81 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Abcg3Q99P81 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Abcg3Q99P81 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Abcg3Q99P81 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Abcg3Q99P81 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms