Protein–RNA interactions for Protein: Q99N92

Mrpl27, 39S ribosomal protein L27, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl27Q99N92 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Mrpl27Q99N92 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Mrpl27Q99N92 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Mrpl27Q99N92 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl27Q99N92 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl27Q99N92 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl27Q99N92 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl27Q99N92 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl27Q99N92 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl27Q99N92 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl27Q99N92 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl27Q99N92 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl27Q99N92 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl27Q99N92 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl27Q99N92 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl27Q99N92 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl27Q99N92 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl27Q99N92 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl27Q99N92 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl27Q99N92 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl27Q99N92 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl27Q99N92 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl27Q99N92 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl27Q99N92 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl27Q99N92 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl27Q99N92 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl27Q99N92 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl27Q99N92 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl27Q99N92 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl27Q99N92 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl27Q99N92 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl27Q99N92 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl27Q99N92 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl27Q99N92 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl27Q99N92 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl27Q99N92 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl27Q99N92 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl27Q99N92 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl27Q99N92 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl27Q99N92 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl27Q99N92 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl27Q99N92 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl27Q99N92 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl27Q99N92 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl27Q99N92 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl27Q99N92 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl27Q99N92 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl27Q99N92 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl27Q99N92 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl27Q99N92 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl27Q99N92 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl27Q99N92 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl27Q99N92 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl27Q99N92 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl27Q99N92 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl27Q99N92 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl27Q99N92 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl27Q99N92 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl27Q99N92 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl27Q99N92 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl27Q99N92 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl27Q99N92 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl27Q99N92 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl27Q99N92 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl27Q99N92 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl27Q99N92 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl27Q99N92 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl27Q99N92 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl27Q99N92 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl27Q99N92 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl27Q99N92 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl27Q99N92 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl27Q99N92 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl27Q99N92 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl27Q99N92 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl27Q99N92 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl27Q99N92 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl27Q99N92 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl27Q99N92 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl27Q99N92 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl27Q99N92 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl27Q99N92 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl27Q99N92 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl27Q99N92 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl27Q99N92 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl27Q99N92 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl27Q99N92 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl27Q99N92 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl27Q99N92 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl27Q99N92 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl27Q99N92 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl27Q99N92 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl27Q99N92 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl27Q99N92 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl27Q99N92 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl27Q99N92 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl27Q99N92 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl27Q99N92 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl27Q99N92 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl27Q99N92 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms