Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd1Q99MV1 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.9 ms