Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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