Protein–RNA interactions for Protein: Q99MP8

Brap, BRCA1-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BrapQ99MP8 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
BrapQ99MP8 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BrapQ99MP8 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BrapQ99MP8 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BrapQ99MP8 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BrapQ99MP8 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BrapQ99MP8 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BrapQ99MP8 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BrapQ99MP8 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
BrapQ99MP8 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
BrapQ99MP8 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BrapQ99MP8 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BrapQ99MP8 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BrapQ99MP8 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BrapQ99MP8 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BrapQ99MP8 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BrapQ99MP8 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BrapQ99MP8 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BrapQ99MP8 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BrapQ99MP8 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BrapQ99MP8 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
BrapQ99MP8 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BrapQ99MP8 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BrapQ99MP8 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BrapQ99MP8 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BrapQ99MP8 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BrapQ99MP8 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BrapQ99MP8 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BrapQ99MP8 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BrapQ99MP8 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BrapQ99MP8 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BrapQ99MP8 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BrapQ99MP8 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BrapQ99MP8 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BrapQ99MP8 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BrapQ99MP8 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BrapQ99MP8 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BrapQ99MP8 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BrapQ99MP8 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BrapQ99MP8 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BrapQ99MP8 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BrapQ99MP8 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BrapQ99MP8 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BrapQ99MP8 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BrapQ99MP8 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BrapQ99MP8 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BrapQ99MP8 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BrapQ99MP8 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BrapQ99MP8 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BrapQ99MP8 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BrapQ99MP8 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BrapQ99MP8 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BrapQ99MP8 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BrapQ99MP8 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BrapQ99MP8 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BrapQ99MP8 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BrapQ99MP8 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
BrapQ99MP8 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
BrapQ99MP8 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
BrapQ99MP8 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
BrapQ99MP8 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BrapQ99MP8 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BrapQ99MP8 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BrapQ99MP8 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BrapQ99MP8 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BrapQ99MP8 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BrapQ99MP8 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BrapQ99MP8 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BrapQ99MP8 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BrapQ99MP8 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BrapQ99MP8 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BrapQ99MP8 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BrapQ99MP8 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BrapQ99MP8 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BrapQ99MP8 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BrapQ99MP8 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BrapQ99MP8 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BrapQ99MP8 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BrapQ99MP8 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BrapQ99MP8 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BrapQ99MP8 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BrapQ99MP8 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BrapQ99MP8 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BrapQ99MP8 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BrapQ99MP8 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
BrapQ99MP8 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BrapQ99MP8 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BrapQ99MP8 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BrapQ99MP8 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BrapQ99MP8 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BrapQ99MP8 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BrapQ99MP8 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BrapQ99MP8 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BrapQ99MP8 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BrapQ99MP8 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BrapQ99MP8 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BrapQ99MP8 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BrapQ99MP8 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BrapQ99MP8 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BrapQ99MP8 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms