Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms