Protein–RNA interactions for Protein: Q99KJ0

Ubxn2a, UBX domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2aQ99KJ0 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubxn2aQ99KJ0 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubxn2aQ99KJ0 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubxn2aQ99KJ0 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubxn2aQ99KJ0 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubxn2aQ99KJ0 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubxn2aQ99KJ0 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubxn2aQ99KJ0 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubxn2aQ99KJ0 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubxn2aQ99KJ0 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubxn2aQ99KJ0 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubxn2aQ99KJ0 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubxn2aQ99KJ0 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubxn2aQ99KJ0 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubxn2aQ99KJ0 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubxn2aQ99KJ0 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubxn2aQ99KJ0 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubxn2aQ99KJ0 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubxn2aQ99KJ0 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubxn2aQ99KJ0 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubxn2aQ99KJ0 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubxn2aQ99KJ0 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubxn2aQ99KJ0 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubxn2aQ99KJ0 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubxn2aQ99KJ0 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubxn2aQ99KJ0 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubxn2aQ99KJ0 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubxn2aQ99KJ0 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubxn2aQ99KJ0 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubxn2aQ99KJ0 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubxn2aQ99KJ0 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubxn2aQ99KJ0 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubxn2aQ99KJ0 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubxn2aQ99KJ0 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubxn2aQ99KJ0 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubxn2aQ99KJ0 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubxn2aQ99KJ0 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubxn2aQ99KJ0 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubxn2aQ99KJ0 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubxn2aQ99KJ0 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubxn2aQ99KJ0 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubxn2aQ99KJ0 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubxn2aQ99KJ0 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubxn2aQ99KJ0 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubxn2aQ99KJ0 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubxn2aQ99KJ0 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubxn2aQ99KJ0 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubxn2aQ99KJ0 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubxn2aQ99KJ0 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubxn2aQ99KJ0 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubxn2aQ99KJ0 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubxn2aQ99KJ0 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubxn2aQ99KJ0 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubxn2aQ99KJ0 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubxn2aQ99KJ0 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms