Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY6

Higd1b, HIG1 domain family member 1B, mousemouse

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Length 98 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1bQ99JY6 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Higd1bQ99JY6 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Higd1bQ99JY6 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Higd1bQ99JY6 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Higd1bQ99JY6 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Higd1bQ99JY6 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Higd1bQ99JY6 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Higd1bQ99JY6 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Higd1bQ99JY6 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Higd1bQ99JY6 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Higd1bQ99JY6 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Higd1bQ99JY6 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Higd1bQ99JY6 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Higd1bQ99JY6 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Higd1bQ99JY6 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Higd1bQ99JY6 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Higd1bQ99JY6 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Higd1bQ99JY6 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Higd1bQ99JY6 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Higd1bQ99JY6 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Higd1bQ99JY6 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Higd1bQ99JY6 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Higd1bQ99JY6 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Higd1bQ99JY6 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Higd1bQ99JY6 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Higd1bQ99JY6 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Higd1bQ99JY6 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Higd1bQ99JY6 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Higd1bQ99JY6 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Higd1bQ99JY6 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Higd1bQ99JY6 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Higd1bQ99JY6 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Higd1bQ99JY6 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Higd1bQ99JY6 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Higd1bQ99JY6 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Higd1bQ99JY6 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Higd1bQ99JY6 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Higd1bQ99JY6 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Higd1bQ99JY6 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Higd1bQ99JY6 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Higd1bQ99JY6 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Higd1bQ99JY6 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Higd1bQ99JY6 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Higd1bQ99JY6 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Higd1bQ99JY6 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Higd1bQ99JY6 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Higd1bQ99JY6 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Higd1bQ99JY6 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Higd1bQ99JY6 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Higd1bQ99JY6 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Higd1bQ99JY6 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Higd1bQ99JY6 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Higd1bQ99JY6 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Higd1bQ99JY6 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Higd1bQ99JY6 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Higd1bQ99JY6 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Higd1bQ99JY6 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Higd1bQ99JY6 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Higd1bQ99JY6 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Higd1bQ99JY6 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Higd1bQ99JY6 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Higd1bQ99JY6 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Higd1bQ99JY6 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Higd1bQ99JY6 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Higd1bQ99JY6 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Higd1bQ99JY6 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Higd1bQ99JY6 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Higd1bQ99JY6 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Higd1bQ99JY6 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Higd1bQ99JY6 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Higd1bQ99JY6 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Higd1bQ99JY6 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Higd1bQ99JY6 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Higd1bQ99JY6 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Higd1bQ99JY6 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Higd1bQ99JY6 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Higd1bQ99JY6 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Higd1bQ99JY6 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms