Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB6

Foxp3, Forkhead box protein P3, mousemouse

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Length 429 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxp3Q99JB6 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Foxp3Q99JB6 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Foxp3Q99JB6 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Foxp3Q99JB6 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Foxp3Q99JB6 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxp3Q99JB6 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxp3Q99JB6 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxp3Q99JB6 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxp3Q99JB6 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxp3Q99JB6 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxp3Q99JB6 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxp3Q99JB6 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxp3Q99JB6 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxp3Q99JB6 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxp3Q99JB6 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxp3Q99JB6 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxp3Q99JB6 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxp3Q99JB6 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxp3Q99JB6 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxp3Q99JB6 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxp3Q99JB6 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxp3Q99JB6 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxp3Q99JB6 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxp3Q99JB6 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxp3Q99JB6 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxp3Q99JB6 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxp3Q99JB6 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxp3Q99JB6 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxp3Q99JB6 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxp3Q99JB6 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxp3Q99JB6 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxp3Q99JB6 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxp3Q99JB6 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxp3Q99JB6 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxp3Q99JB6 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxp3Q99JB6 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxp3Q99JB6 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxp3Q99JB6 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxp3Q99JB6 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxp3Q99JB6 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxp3Q99JB6 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxp3Q99JB6 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxp3Q99JB6 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxp3Q99JB6 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxp3Q99JB6 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxp3Q99JB6 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxp3Q99JB6 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxp3Q99JB6 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxp3Q99JB6 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxp3Q99JB6 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxp3Q99JB6 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxp3Q99JB6 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxp3Q99JB6 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxp3Q99JB6 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxp3Q99JB6 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxp3Q99JB6 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxp3Q99JB6 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxp3Q99JB6 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxp3Q99JB6 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxp3Q99JB6 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxp3Q99JB6 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxp3Q99JB6 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxp3Q99JB6 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxp3Q99JB6 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxp3Q99JB6 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxp3Q99JB6 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxp3Q99JB6 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxp3Q99JB6 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxp3Q99JB6 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxp3Q99JB6 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxp3Q99JB6 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxp3Q99JB6 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxp3Q99JB6 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxp3Q99JB6 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxp3Q99JB6 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxp3Q99JB6 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxp3Q99JB6 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxp3Q99JB6 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxp3Q99JB6 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxp3Q99JB6 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxp3Q99JB6 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxp3Q99JB6 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxp3Q99JB6 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxp3Q99JB6 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Foxp3Q99JB6 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Foxp3Q99JB6 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Foxp3Q99JB6 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Foxp3Q99JB6 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Foxp3Q99JB6 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Foxp3Q99JB6 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Foxp3Q99JB6 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Foxp3Q99JB6 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Foxp3Q99JB6 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Foxp3Q99JB6 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Foxp3Q99JB6 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Foxp3Q99JB6 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Foxp3Q99JB6 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Foxp3Q99JB6 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Foxp3Q99JB6 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Foxp3Q99JB6 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms