Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smim11aQ99J19 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smim11aQ99J19 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smim11aQ99J19 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smim11aQ99J19 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smim11aQ99J19 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smim11aQ99J19 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Smim11aQ99J19 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smim11aQ99J19 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smim11aQ99J19 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smim11aQ99J19 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Smim11aQ99J19 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smim11aQ99J19 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smim11aQ99J19 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Smim11aQ99J19 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smim11aQ99J19 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smim11aQ99J19 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smim11aQ99J19 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smim11aQ99J19 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smim11aQ99J19 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smim11aQ99J19 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smim11aQ99J19 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smim11aQ99J19 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smim11aQ99J19 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smim11aQ99J19 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smim11aQ99J19 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smim11aQ99J19 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smim11aQ99J19 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smim11aQ99J19 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smim11aQ99J19 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smim11aQ99J19 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smim11aQ99J19 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smim11aQ99J19 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smim11aQ99J19 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smim11aQ99J19 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smim11aQ99J19 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim11aQ99J19 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim11aQ99J19 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim11aQ99J19 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim11aQ99J19 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim11aQ99J19 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim11aQ99J19 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim11aQ99J19 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim11aQ99J19 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim11aQ99J19 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim11aQ99J19 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim11aQ99J19 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Smim11aQ99J19 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Smim11aQ99J19 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Smim11aQ99J19 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim11aQ99J19 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim11aQ99J19 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim11aQ99J19 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Smim11aQ99J19 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim11aQ99J19 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim11aQ99J19 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim11aQ99J19 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim11aQ99J19 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
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Smim11aQ99J19 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim11aQ99J19 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Smim11aQ99J19 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim11aQ99J19 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Smim11aQ99J19 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim11aQ99J19 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim11aQ99J19 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim11aQ99J19 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim11aQ99J19 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim11aQ99J19 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim11aQ99J19 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim11aQ99J19 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim11aQ99J19 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Smim11aQ99J19 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim11aQ99J19 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Smim11aQ99J19 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms