Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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Ctu1Q99J10 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Ctu1Q99J10 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Ctu1Q99J10 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Ctu1Q99J10 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Ctu1Q99J10 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Ctu1Q99J10 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Ctu1Q99J10 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Ctu1Q99J10 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Ctu1Q99J10 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Ctu1Q99J10 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
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Ctu1Q99J10 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Ctu1Q99J10 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Ctu1Q99J10 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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