Protein–RNA interactions for Protein: Q925Q3

Slc8b1, Mitochondrial sodium/calcium exchanger protein, mousemouse

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Length 585 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8b1Q925Q3 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Slc8b1Q925Q3 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Slc8b1Q925Q3 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Slc8b1Q925Q3 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Slc8b1Q925Q3 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Slc8b1Q925Q3 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Slc8b1Q925Q3 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Slc8b1Q925Q3 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Slc8b1Q925Q3 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Slc8b1Q925Q3 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Slc8b1Q925Q3 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Slc8b1Q925Q3 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Slc8b1Q925Q3 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Slc8b1Q925Q3 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Slc8b1Q925Q3 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Slc8b1Q925Q3 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Slc8b1Q925Q3 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Slc8b1Q925Q3 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Slc8b1Q925Q3 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Slc8b1Q925Q3 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Slc8b1Q925Q3 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Slc8b1Q925Q3 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Slc8b1Q925Q3 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
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Slc8b1Q925Q3 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Slc8b1Q925Q3 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Slc8b1Q925Q3 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Slc8b1Q925Q3 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Slc8b1Q925Q3 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Slc8b1Q925Q3 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Slc8b1Q925Q3 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Slc8b1Q925Q3 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Slc8b1Q925Q3 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Slc8b1Q925Q3 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Slc8b1Q925Q3 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Slc8b1Q925Q3 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Slc8b1Q925Q3 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Slc8b1Q925Q3 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Slc8b1Q925Q3 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Slc8b1Q925Q3 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Slc8b1Q925Q3 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Slc8b1Q925Q3 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Slc8b1Q925Q3 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Slc8b1Q925Q3 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Slc8b1Q925Q3 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Slc8b1Q925Q3 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Slc8b1Q925Q3 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Slc8b1Q925Q3 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Slc8b1Q925Q3 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Slc8b1Q925Q3 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Slc8b1Q925Q3 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Slc8b1Q925Q3 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Slc8b1Q925Q3 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Slc8b1Q925Q3 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Slc8b1Q925Q3 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Slc8b1Q925Q3 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Slc8b1Q925Q3 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Slc8b1Q925Q3 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Slc8b1Q925Q3 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Slc8b1Q925Q3 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Slc8b1Q925Q3 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Slc8b1Q925Q3 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Slc8b1Q925Q3 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Slc8b1Q925Q3 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Slc8b1Q925Q3 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
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Slc8b1Q925Q3 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Slc8b1Q925Q3 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms